Это аббревиатура, поэтому буквы воспроизводятся также как в алфавите. До недавнего обновления норм языка было: Сэ, Шэ, А. Если смотреть сейчас, то получится Эс, Ша, А.
А традиция произносить в "США" не [эс] произрастает из прежнего нормализованного наименования САСШ (Северно-Американские Соединенные Штаты). Аббревиатура США появилось только после 1920-х годов.
А вообще, с точки зрения произнесения, аббревиатуры делятся на буквенные (такие аббревиатуры произносятся по названиям букв), звуковые (такие аббревиатуры произносятся как обычные существительные) и буквенно-звуковые (смешанные). США - звуковая аббревиатура, а не буквенная.